Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cttnbp2B9EJA2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cttnbp2B9EJA2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms