Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce3B5KM66 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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