Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Phf11bB4XVQ1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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