Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clrn2B2RVW2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms