Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AU015836B2RUM3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms