Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uhrf1bp1B2KF50 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms