Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nfx1B1AY10 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms