Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik3B1AS29 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms