Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slfn8B1ARD8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms