Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms