Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms