Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd5A2A8L1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms