Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms