Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms