Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Hdac5Q9Z2V6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Hdac5Q9Z2V6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdac5Q9Z2V6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac5Q9Z2V6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac5Q9Z2V6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac5Q9Z2V6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac5Q9Z2V6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac5Q9Z2V6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac5Q9Z2V6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac5Q9Z2V6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac5Q9Z2V6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms