Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trpc2Q9R244 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trpc2Q9R244 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trpc2Q9R244 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trpc2Q9R244 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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