Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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