Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms