Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms