Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nectin3Q9JLB9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin3Q9JLB9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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