Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgn5Q9JL35 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hmgn5Q9JL35 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hmgn5Q9JL35 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgn5Q9JL35 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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