Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms