Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rb1cc1Q9ESK9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rb1cc1Q9ESK9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms