Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhox9Q9EQM5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox9Q9EQM5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms