Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SgshQ9EQ08 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms