Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms