Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tspan4Q9DCK3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tspan4Q9DCK3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tspan4Q9DCK3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tspan4Q9DCK3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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