Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Csnk1dQ9DC28 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Csnk1dQ9DC28 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Csnk1dQ9DC28 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Csnk1dQ9DC28 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1dQ9DC28 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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