Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 1700102F20Rik-201ENSMUST00000203859 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Tefm-201ENSMUST00000050207 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Cd40lg-201ENSMUST00000033466 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Olfr1178-201ENSMUST00000075640 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms