Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Swt1Q9DBQ9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms