Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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