Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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