Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms