Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms