Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms