Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg7Q9D906 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms