Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Derl3Q9D8K3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms