Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Alg13Q9D8C3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Alg13Q9D8C3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Alg13Q9D8C3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Alg13Q9D8C3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Alg13Q9D8C3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alg13Q9D8C3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Alg13Q9D8C3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Alg13Q9D8C3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Alg13Q9D8C3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alg13Q9D8C3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alg13Q9D8C3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alg13Q9D8C3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alg13Q9D8C3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alg13Q9D8C3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alg13Q9D8C3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alg13Q9D8C3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Alg13Q9D8C3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alg13Q9D8C3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alg13Q9D8C3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Alg13Q9D8C3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alg13Q9D8C3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Alg13Q9D8C3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Alg13Q9D8C3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms