Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slx4ipQ9D7Y9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms