Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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