Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Borcs6Q9D6W8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Borcs6Q9D6W8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Borcs6Q9D6W8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Borcs6Q9D6W8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Borcs6Q9D6W8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Borcs6Q9D6W8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Borcs6Q9D6W8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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