Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmtm5Q9D6G9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms