Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms