Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D2Q3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D2Q3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D2Q3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D2Q3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D2Q3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D2Q3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D2Q3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Q9D2Q3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D2Q3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms