Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc8Q9D2H8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc8Q9D2H8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc8Q9D2H8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc8Q9D2H8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc8Q9D2H8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc8Q9D2H8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc8Q9D2H8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc8Q9D2H8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fndc8Q9D2H8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms