Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem88Q9D0N8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms