Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Exosc7Q9D0M0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Exosc7Q9D0M0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Exosc7Q9D0M0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Exosc7Q9D0M0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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