Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms