Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Exo5Q9CXP9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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