Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Xrcc3Q9CXE6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
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Xrcc3Q9CXE6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Xrcc3Q9CXE6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Xrcc3Q9CXE6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Xrcc3Q9CXE6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Xrcc3Q9CXE6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Xrcc3Q9CXE6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Xrcc3Q9CXE6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Xrcc3Q9CXE6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Xrcc3Q9CXE6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Xrcc3Q9CXE6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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